An open-source software for the simulation of fixational eye movements
Allgeier, S.; Anzlinger, F.; Bohn, S.; Mikut, R.; Neumann, O.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Sperlich, K.
2024. Current Directions in Biomedical Engineering, 10 (4), 25–28. doi:10.1515/cdbme-2024-2007

In vivo examinations of the dendritic cell dynamics in the human cornea
Bohn, S.; Wagner, E.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.
2024, May. ARVO Annual Meeting (2024), Seattle, WA, USA, May 5–9, 2024

Chromatic Swept-Source Corneal Confocal Microscopy
Sperlich, K.; Bohn, S.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Stolz, H.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2024, May. ARVO Annual Meeting (2024), Seattle, WA, USA, May 5–9, 2024

On the reproducibility of extrusion-based bioprinting: round robin study on standardization in the field
Grijalva Garces, D.; Strauß, S.; Gretzinger, S.; Schmieg, B.; Jüngst, T.; Groll, J.; Meinel, L.; Schmidt, I.; Hartmann, H.; Schenke-Layland, K.; Brandt, N.; Selzer, M.; Zimmermann, S.; Koltay, P.; Southan, A.; Tovar, G. E. M.; Schmidt, S.; Weber, A.; Ahlfeld, T.; Gelinsky, M.; Scheibel, T.; Detsch, R.; Boccaccini, A. R.; Naolou, T.; Lee-Thedieck, C.; Willems, C.; Groth, T.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Friedrich, T.; Briesen, H.; Buchholz, J.; Paulus, D.; von Gladiss, A.; Hubbuch, J.
2024. Biofabrication, 16 (1), Art.-Nr.: 015002. doi:10.1088/1758-5090/acfe3b

Chromatic Swept-Source Laser Scanning - Konzept für eine zellauflösende konfokale Laserspaltlampe? [Chromatic Swept-Source Laser Scanning - Concept for a Cell-Resolving Confocal Laser Slit Lamp?]
Sperlich, K.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Stolz, H.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.; Allgeier, S.
2023. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 240 (12), 1375 – 1382. doi:10.1055/a-2184-9382

Towards the big picture - Fusion of large image datasets
Allgeier, S.
2023, September 29. 121. Kongress der Deutschen Ophthalmologischen Gesellschaft (DOG 2023), Berlin, Germany, September 28–October 1, 2023

Longitudinal evaluation of the subbasal nerve plexus at identical corneal regions by large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R.; Stachs, O.
2023. Investigative ophthalmology & visual science, 64 (8), Art.-Nr.: 4025

Taxane-Induced Neuropathy and Its Ocular Effects—A Longitudinal Follow-up Study in Breast Cancer Patients
Stache, N.; Bohn, S.; Sperlich, K.; George, C.; Winter, K.; Schaub, F.; Do, H.-V.; Röhlig, M.; Reichert, K.-M.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Stachs, A.; Sterenczak, K. A.
2023. Cancers, 15 (9), Art.-Nr.: 2444. doi:10.3390/cancers15092444

In vivo Untersuchungen zur Dynamik dendritischer Zellen im subbasalen Nervenplexus der Kornea
Wagner E.; Bohn S.; Sperlich K.; Allgeier, S.; Reichert K.-M.; Stachs O.
2023. 121. Kongress der Deutschen Ophthalmologischen Gesellschaft (DOG 2023), Berlin, Germany, September 28–October 1, 2023

Hexapod-basierte dreidimensionale konfokale Hornhautmikroskopie zur Charakterisierung stromaler Nerven
Richter J.; Sperlich K.; Bohn S.; Allgeier, S.; Reichert K.-M.; Stachs O.
2023. 121. Kongress der Deutschen Ophthalmologischen Gesellschaft (DOG 2023), Berlin, Germany, September 28–October 1, 2023

Mosaic vs. Single Image Analysis with Confocal Microscopy of the Corneal Nerve Plexus for Diagnosis of Early Diabetic Peripheral Neuropathy
Matuszewska-Iwanicka, A.; Stratmann, B.; Stachs, O.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Winter, K.; Guthoff, R.; Tschoepe, D.; Hettlich, H.-J.
2022. Ophthalmology and Therapy, 11 (6), 2211–2223. doi:10.1007/s40123-022-00574-z

Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2022, September 29. 120. Deutsche Ophthalmologische Gesellschaft e.V.: Kongress (DOG-Kongress 2022), Berlin, Germany, September 29–October 2, 2022

Volume registration of in vivo confocal microscopy datasets of the human cornea - a comparison of two novel approaches
Allgeier, S.; Bohn, S.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2022, September 28. 14th Joint Annual Conference of the Austrian (ÖGBMT), German (VDE DGBMT) and Swiss (SSBE) Societies for Biomedical Engineering (BMT 2022), Innsbruck, Austria, September 28–30, 2022

Abstractband DOG 2022; Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R., F.; Stachs, O.
2022. Die Ophthalmologie, 119 (S3), 157–344. doi:10.1007/s00347-022-01723-2

Real-time large-area imaging of the corneal subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Guthoff, R. F.; Hagenmeyer, V.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stache, N.; Stachs, O.; Köhler, B.
2022. Scientific reports, 12, Article no: 2481. doi:10.1038/s41598-022-05983-5

Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2022. Der Ophthalmologe, 119 (Suppl 3), 170

Assessment of dynamic corneal nerve changes using static landmarks by in vivo large-area confocal microscopy—a longitudinal proof-of-concept study
Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Marfurt, C. F.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, A.; Stachs, O.; Bohn, S.
2022. Quantitative Imaging in Medicine and Surgery, 12 (10), 4734–4746. doi:10.21037/qims-22-15

In vivo monitoring of corneal dendritic cells in the subbasal nerve plexus during Trastuzumab and Paclitaxel breast cancer therapy - a one-year follow-up
Bohn, S.; Stache, N.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Bartschat, A.; Do, H.-V.; George, C.; Guthoff, R. F.; Stachs, A.; Stachs, O.; Sterenczak, K. A.
2022. Diagnostics, 12 (5), 1180. doi:10.3390/diagnostics12051180

Wide-field mosaics of the corneal subbasal nerve plexus in Parkinson’s disease using in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Allgeier, S.; Scarpa, F.; Andréasson, M.; Bartschat, A.; Mikut, R.; Colonna, A.; Bellisario, M.; Utheim, T. P.; Köhler, B.; Svenningsson, P.; Lagali, N.
2021. Scientific data, 8 (1), Article no: 306. doi:10.1038/s41597-021-01087-3

The effects of pattern screen surface deformation on deflectometric measurements - A simulation study
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2021. Automated Visual Inspection and Machine Vision IV: SPIE Optical Metrology, 21-26 June 2021. Ed.: J. Beyerer, Art.-Nr.: 1178708, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2591877

Morphological characterization of the human corneal epithelium by in vivo confocal laser scanning microscopy
Sterenczak, K. A.; Winter, K.; Sperlich, K.; Stahnke, T.; Linke, S.; Farrokhi, S.; Klemm, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Bohn, S.; Stachs, O.
2021. Quantitative imaging in medicine and surgery, 11 (5), 1737–1750. doi:10.21037/qims-20-1052

Parkinson’s disease with restless legs syndrome - an in vivo corneal confocal microscopy study
Andréasson, M.; Lagali, N.; Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Scarpa, F.; Colonna, A.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Solders, G.; Samuelsson, K.; Zetterberg, H.; Blennow, K.; Svenningsson, P.
2021. npj Parkinson’s Disease, 7 (1), Art.-Nr. 4. doi:10.1038/s41531-020-00148-5

Influence of contact cap design on large-area imaging of the subbasal nerve plexus
Bohn, S.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2021. Biomedical engineering, 66 (s1), S124. doi:10.1515/bmt-2021-6018

A software framework for real-time image mosaicking of the corneal subbasal nerve plexus
Köhler, B.; Kornelius, L.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Allgeier, S.
2021. Biomedical engineering, 66 (s1), S121

Burst of corneal dendritic cells during Trastuzumab and Paclitaxel treatment
Sterenczak, K. A.; Stache, N.; Bohn, S.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Bartschat, A.; George, C.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.; Stachs, A.
2021. Diagnostics, 11 (5), Art.Nr. 838. doi:10.3390/diagnostics11050838

Atypical cellular elements of unknown origin in the subbasal nerve plexus of a diabetic cornea diagnosed by large-area confocal laser scanning microscopy
Sterenczak, K. A.; Stachs, O.; Marfurt, C.; Matuszewska-Iwanicka, A.; Stratmann, B.; Sperlich, K.; Guthoff, R. F.; Hettlich, H.-J.; Allgeier, S.; Stahnke, T.
2021. Diagnostics, 11 (2), Article no: 154. doi:10.3390/diagnostics11020154

In vivo Histology of the Cornea – from the “Rostock Cornea Module” to the “Rostock Electronic Slit Lamp” – a Clinical “Proof of Concept” Study
Bohn, S.; Stahnke, T.; Sperlich, K.; Linke, S. J.; Farrokhi, S.; Klemm, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Witt, M.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.
2020. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 237 (12), 1442–1454. doi:10.1055/a-1297-4717

3D Imaging Technique for High-Resolution Slit Lamp Microscopy in Ophthalmology
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2020. Biomedical engineering, 65 (s1), S126

Automated fabrication of hybrid printed electronic circuits
Gengenbach, U.; Ungerer, M.; Koker, L.; Reichert, K.-M.; Stiller, P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Zhu, X.; Huang, C.; Hagenmeyer, V.
2020. Mechatronics, 70, 102403. doi:10.1016/j.mechatronics.2020.102403

3D imaging technique for high-resolution slit lamp microscopy in ophthalmology
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Köhler, B.
2020, September. 54th Annual Conference of the German Society for Biomedical Engineering (DGBMT 2020), Online, September 29–October 1, 2020

Reproducibility of two calibration procedures for phase-measuring deflectometry
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2020. Interferometry XX : 24 August - 4 September 2020, online only, United States. Ed.: M.B. North Morris, 14, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2567092

Fuzzy tissue detection for real-time focal control in corneal confocal microscopy = Fuzzy-Gewebeerkennung für Echtzeit-Fokusregelung in der Kornea-Konfokalmikroskopie
Bartschat, A.; Allgeier, S.; Scherr, T.; Stegmaier, J.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Kuijper, A.; Reischl, M.; Stachs, O.; Köhler, B.; Mikut, R.
2019. Automatisierungstechnik, 67 (10), 879–888. doi:10.1515/auto-2019-0034

Volume reconstruction of the human cornea with oscillating focus scans
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2019. Biomedical engineering, 64 (s2), S193. doi:10.1515/bmt-2019-6023

Robust phase unwrapping based on non-coprime fringe pattern periods for deflectometry measurements
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2019. Automated Visual Inspection and Machine Vision III - SPIE Optical Metrology, 2019, Munich, Germany, 24-27 JUNE 2019. Ed.: J. Beyerer, F. Puente León, 1106103, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2523564

Digitale Bildverarbeitung und Tiefe Neuronale Netze in der Augenheilkunde – aktuelle Trends - Digital Image Processing and Deep Neural Networks in Ophthalmology – Current Trends
Bartschat, A.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Scherr, T.; Blessing, D.; Reichert, K.-M.; Reischl, M.; Stachs, O.; Koehler, B.; Mikut, R.
2019. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 236 (12), 1399–1406. doi:10.1055/a-1008-9400

3D confocal laser-scanning microscopy for large-area imaging of the corneal subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Walckling, M.; Hagenmeyer, V.; Mikut, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2018. Scientific reports, 8 (1), Article Number 7468. doi:10.1038/s41598-018-25915-6

Corneal Subbasal Nerve Plexus Changes in Severe Diabetic Charcot Foot Deformity: A Pilot Study in Search for a DNOAP Biomarker
Herlyn, A.; Prakasam, R. K.; Peschel, S.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Guthoff, R. F.; Mittlmeier, T.; Stachs, O.
2018. Journal of diabetes research, 2018, Art. Nr.: 5910639. doi:10.1155/2018/5910639

Cross-sectional image quality improvements in 3D corneal confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Prakasam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018, September 27. 116. Deutsche Ophthalmologische Gesellschaft e.V.: Kongress (DOG-Kongress 2018), Bonn, Germany, September 27–30, 2018

Analysis of focus shift speed for in vivo 3D corneal confocal microscopy
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Mikut, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2018. Biomedical engineering, 63 (s1), S192. doi:10.1515/bmt-2018-6037

Cellular in vivo 3D imaging of the cornea by confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Prakasam, R.; Reichert, K.-M.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2018. Biomedical optics express, 9 (6), 2511–2525. doi:10.1364/BOE.9.002511

Cross-sectional image quality improvements in 3D corneal confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Prakasam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018. Der Ophthalmologe, 115 (Suppl 1), 74

Slit lamp microscopy on a cellular level using in vivo confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Kala Praksam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R. F.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018. Investigative ophthalmology & visual science, 59 (9), 3439

Wide-field corneal subbasal nerve plexus mosaics in age-controlled healthy and type 2 diabetes populations
Lagali, N. S.; Allgeier, S.; Guimarães, P.; Badian, R. A.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L. B.; Rolandsson, O.
2018. Scientific data, 5, Art.Nr. 180075. doi:10.1038/sdata.2018.75

The corneal subbasal nerve plexus and thickness of the retinal layers in pediatric type 1 diabetes and matched controls
Götze, A.; Keyserlingk, S. von; Peschel, S.; Jacoby, U.; Schreiver, C.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Winter, K.; Röhlig, M.; Jünemann, A.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Fischer, D.-C.
2018. Scientific reports, 8 (1), Art.Nr. 14. doi:10.1038/s41598-017-18284-z

Reduced Corneal Nerve Fiber Density in Type 2 Diabetes by Wide-Area Mosaic Analysis
Lagali, N. S.; Allgeier, S.; Guimarães, P.; Badian, R. A.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L. B.; Rolandsson, O.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (14), Art.Nr. 6318. doi:10.1167/iovs.17-22257

Mosaicking the subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. Acta ophthalmologica, 95 (Suppl.), S259. doi:10.1111/j.1755-3768.2017.03122

Quantification of inflammatory cells in the corneal sub-basal layer in type 2 diabetes by in vivo confocal microscopy (IVCM)
Badian, R. A.; Utheim, T.; Allgeier, S.; Liu, X.; Köhler, B.; Lagali, N. S.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (8), 3535

Augmentations of the Bag of Visual Words Approach for Real-Time Fuzzy and Partial Image Classification
Bartschat, A.; Stegmaier, J.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bohn, S.; Stachs, O.; Köhler, B.; Mikut, R.
2017. Proceedings. 27. Workshop Computational Intelligence, Dortmund, 23. - 24. November 2017. Hrsg.: F. Hoffmann, 227–242, KIT Scientific Publishing

Ein neues Konzept zur automatischen Erstellung von Mosaikbildern der Kornea für die Diagnose neuropathischer Erkrankungen. PhD dissertation
Allgeier, S. T.
2017. Karlsruher Institut für Technologie (KIT). doi:10.5445/IR/1000076325

Rechnergesteuerte Fokusnachführung zur großflächigen Abbildung des subbasalen Nervenplexus als Biomarker für diabetische Neuropathie
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat. A.; Reichert, K. M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2017. Der Ophthalmologe, (Suppl.2), S32

Rechnergesteuerte Fokusnachführung zur großflächigen Abbildung des subbasalen Nervenplexus als Biomarker für diabetische Neuropathie
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat. A.; Reichert, K. M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2017. 115. DOG-Kongress (2017), Berlin, Germany, September 28–October 1, 2017

Computer-controlled analysis of solid state nuclear track detectors
Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Fesenbeck, I.; Naber, C.; Allgeier, S.
2017. Biomedizinische Technik, 62 (S1), S506

Computer-controlled analysis of solid state nuclear track detectors
Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Fesenbeck, I.; Naber, C.; Allgeier, S.
2017. 51. Jahrestagung der Biomedizinischen Technik und Dreiländertagung der Medizinischen Physik (BMT 2017), Dresden, Germany, September 10–13, 2017

Concepts for automated fast focal plane control in subbasal nerve plexus mosaicking to reliably quantify a biomarker for diabetic peripheral neuropathy
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Stachs, O.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (8), Art. Nr.: 1431

Mosaicking the subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. European Association for Vision and Eye Research (EVER) Congress 2017, Nice, F, September 27-30, 2017

Concepts for automated fast focal plane control in subbasal nerve plexus mosaicking to reliably quantify a biomarker for diabetic peripheral neuropathy
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Stachs, O.
2017. ARVO Annual Meeting, Baltimore, MD, May 7-11, 2017

Spatial analysis improves the detection of early corneal nerve fiber loss in patients with recently diagnosed type 2 diabetes
Ziegler, D.; Winter, K.; Strom, A.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Ringel, B.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2017. PLoS one, 12 (3), e0173832. doi:10.1371/journal.pone.0173832

In-vivo-Bildgebung des kornealen Nervenplexus : Vom Einzelbild zur großflächigen Darstellung
Köhler, B.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R. F.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Winter, K.; Mikut, R.
2017. Der Ophthalmologe, 114 (7), 601–607. doi:10.1007/s00347-017-0464-4

Morphometrische Charakterisierung des subbasalen Nervenplexus, Detektion und Analyse von Nervenfasernetzwerken
Winter, K.; Scheibe, P.; Guthoff, R. F.; Allgeier, S.; Stachs, O.
2017. Der Ophthalmologe, 114 (7), 608–616. doi:10.1007/s00347-017-0465-3

Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by in vivo confocal microscopy and histological staining
Kowtharapu, B. S.; Winter, K.; Marfurt, C.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Hovakimyan, M.; Stahnke, T.; Wree, A.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.
2017. Eye, 31, 481–490. doi:10.1038/eye.2016.220

A Novel Approach to Analyze the Progression of Measured Corneal Sub-Basal Nerve Fiber Length in Continuously Expanding Mosaic Images
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. Current eye research, 42 (4), 549–556. doi:10.1080/02713683.2016.1221977

Quantitative analysis of central corneal sub-basal inflammatory cells and dendritic cells in large-area mosaic images obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Lagali, N.
2016. Investigative ophthalmology & visual science, 57 (12), 1929

Analysis of corneal subbasal nerve plexus from wide-area mosaics in healthy subjects and in type 2 diabetics
Lagali, N.; Allgeier, S.; Guimaraes, P.; Badian, R.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L.; Rolandsson, O.
2016. Investigative ophthalmology & visual science, 57 (12), Art. Nr. 6158

Automatic corneal tissue classification using bag-of-visual-words approaches
Bartschat, A.; Toso, L.; Stegmaier, J.; Kuijper, A.; Mikut, R.; Köhler, B.; Allgeier, S.
2016. Forum Bildverarbeitung 2016. Hrsg.: M. Heizmann, 245–256, KIT Scientific Publishing

Analysis of corneal subbasal nerve fiber length in mosaic image series acquired by guided eye movements
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. R.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2016. Biomedizinische Technik, 61 (Suppl.1), 148. doi:10.1515/bmt-2016-5013

Analysis of corneal subbasal nerve fiber length in mosaic image series acquired by guided eye movements
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. R.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2016. „Dreiländertagung“ of Biomedical Engineering, Basel, CH, October 4-6, 2016

EyeGuidance - a computer controlled system to guide eye movements
Köhler, B.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Reichert, K.-M.; Sieber, I.; Stachs, O.; Toso, L.; Allgeier, S.
2016. Current directions in biomedical engineering, 2 (1), 433–436. doi:10.1515/cdbme-2016-0096

EyeGuidance - a computer controlled system to guide eye movements
Köhler, B.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Reichert, K.-M.; Sieber, I.; Stachs, O.; Toso, L.; Allgeier, S.
2016. „Dreiländertagung“ of Biomedical Engineering, Basel, CH, October 4-6, 2016

Quantitative analysis of central corneal sub-basal inflammatory cells and dendritic cells in large-area mosaic images obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Lagali, N.
2016. ARVO 2016 Annual Meeting, Seattle, WA, May 1-5, 2016

Analysis of corneal subbasal nerve plexus from wide-area mosaics in healthy subjects and in type 2 diabetics
Lagali, N.; Allgeier, S.; Guimaraes, P.; Badian, R.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L.; Rolandsson, O.
2016. ARVO 2016 Annual Meeting, Seattle, WA, May 1-5, 2016

Local Variability of Parameters for Characterization of the Corneal Subbasal Nerve Plexus
Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2016. Current eye research, 41 (2), 186–198. doi:10.3109/02713683.2015.1010686

Quantitative analysis of corneal sub-basal nerve plexus and inflammatory cells in large-area mosaics obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Ruggeri, A.; Poletti, E.; Guimares, P.; Lagali, N. S.
2015. Investigative ophthalmology & visual science, 56 (7), 1637

Quantitative analysis of corneal sub-basal nerve pexus and inflammatory cells in large-area mosaics obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Ruggeri, A.; Poletti, E.; Guimares, P.; Lagali, N. S.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, CO, May 3-7, 2015

Local variability of parameters for characterization of the corneal sub-basal nervePlexus
Stachs, O.; Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.
2015. Investigative Ophtalmology and Visual Science, 56 (7), 1636

Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by histologic staining and in vivo confocal microscopy
Guthoff, R. F.; Kowtharapu, B. S.; Hovakimyan, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Stahnke, T.; Marfurt, C. F.; Stachs, O.
2015. Investigative Ophthalmology and Visual Science, 56 (7), 3071

Local variability of parameters for characterization of the corneal sub-basal nerve plexus
Stachs, O.; Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, Colo., May 3-7, 2015

Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by histologic staining and in vivo confocal microscopy
Guthoff, R. F.; Kowtharapu, B. S.; Hovakimyan, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Stahnke, T.; Marfurt, C.; Stachs, O.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, Colo., May 3-7, 2015

Iterative algorithms to generate large scale mosaic images
Toso, L.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Köhler, B.
2015. Bildverarbeitung für die Medizin 2015 : Algrithmen, Systeme, Anwendungen ; Proceedings des Workshops, Lübeck, 15.-17.März 2015. Ed.: H. Handels, 203–208, Springer-Verlag

Iterative algorithms to generate large scale mosaic images
Toso, L.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Köhler, B.
2015. Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Lübeck, 15.-17.März 2015

Großflächige Abbildung kornealer Nervenfasern durch geführte Augenbewegungen
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.
2014. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 231, 1170–1173. doi:10.1055/s-0034-1383331

Early detection of nerve fiber loss by corneal confocal microscopy and skin biopsy in recently diagnosed type 2 diabetes
Ziegler, D.; Papanas, N.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Strom, A.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2014. (German Diabetes Study (GDS) Group., Ed.) Diabetes, 63 (7), 2454–2463. doi:10.2337/db13-1819

Mosaicking the subbasal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Maier, S.; Mikut, R.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2014. Investigative Ophthalmology & Visual Science, 55 (9), 6082–6089. doi:10.1167/iovs.14-14698

Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Köhler, B.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Wezel, J. van; Mikut, R.; Bretthauer, G.
2014. Biomedizinische Technik, 59 (s1), s572

Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Köhler, B.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Wezel, J. van; Mikut, R.; Bretthauer, G.
2014. BMT 2014 : 48.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Hannover, 8.-10.Oktober 2014

Advances in in vivo imaging of corneal nerves
Stachs, O.; Kowtharapu, B. S.; Allgeier, S.; Winter, K.; Köhler, B.
2014. Vision and Diabetes : Leopoldina Symposium, Rostock, March 15-16, 2013 Halle : Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina. Hrsg.: R. F. Guthoff, 115–126, Wissenschaftliche Verlags-Gesellschaft

Software-based imaging and quantitative analysis of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2014. Vision and Diabetes : Leopoldina Symposium, Rostock, March 15-16, 2013 Halle : Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina. Hrsg.: R. F. Guthoff, 127–142, Wissenschaftliche Verlags-Gesellschaft

Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Peschel, S.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2014. 21st ISER Biennial Meeting, San Francisco, Calif., July 20-24, 2014

Software-based imaging and segmentation of corneal nerve fibres
Winter, K.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2013. Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 58 (SUPPL.1). doi:10.1515/bmt-2013-4293

A confocal microscopy study of the anterior corneal mosaic in the sub-basal nerve plexus
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Van Wezel, J.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2013. Biomedizinische Technik, 58 (SUPPL.1). doi:10.1515/bmt-2013-4270

Software-based imaging and quantitative analysis of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2013. Leopoldina Symposium ’Vision and Diabetes’, Rostock, March 15-16, 2013

Erweiterte Darstellung des kornealen Nervenplexus durch Fusion meherer rekonstruierter Bilder zur zuverlässigen Beurteilung der Hornhautinnervation
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2013. Exzellent sehen - Exzellenz Fördern : 111.DOG-Kongress, Berlin, 19.-22.September 2013

Software-based imaging and segmentation of corneal nerve fibres
Winter, K.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2013. Dreiländertagung der Deutschen, Schweizerischen und Österreichischen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT 2013), Graz, A, 19.-21.September 2013

A confocal microscopy study of the anterior corneal mosaic in the sub-basal nerve plexus
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Wezel, J. van; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2013. Dreiländertagung der Deutschen, Schweizerischen und Österreichischen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT 2013), Graz, A, 19.-21.September 2013

Characteristic Quantities of Corneal Epithelial Structures in Confocal Laser Scanning Microscopic Volume Data Sets
Prakasam, R. K.; Winter, K.; Schwiede, M.; Allgeier, S.; Zhivov, A.; Köhler, B.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2013. Cornea, 32 (5), 636–643. doi:10.1097/ICO.0b013e31826247bf

Characteristic quantities of corneal epithelial structures in confocal laser scanning microscopic volume datasets
Stachs, O.; Prakasam, R. K.; Winter, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.
2013. ARVO Annual Meeting, Seattle, Wash., May 5-9, 2013

Confocal microscopy of corneal nerves for early detection of diabetic neuropathy in recently diagnosed type 2 diabetic patients
Zhivov, A.; Ziegler, D.; Peschel, S.; Allgeier, S.; Winter, K.; Koehler, B.; Papanas, N.; Stachs, O.; Roden, M.; Guthoff, R. F.
2013. ARVO Annual Meeting, Seattle, Wash., May 5-9, 2013

Generating extended images of the corneal nerve plexus by guided eye movements
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Reichert, K.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2012. Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 57 (Suppl. 1), 322. doi:10.1515/bmt-2012-4202

Mosaicking images of the corneal sub-basal nerve plexus using hierarchical block-based image registration
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2012. Biomedizinische Technik, 57 (Suppl. 1), 30–33. doi:10.1515/bmt-2012-4201

Early detection of nerve fibre loss by corneal confocal microscopy and skin biopsy in recently diagnosed type 2 diabetic subjects
Ziegler, D.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2012. 48th Annual Meeting of the European Association for the Study of Diabetes (EASD 2012), Berlin, October 2-5, 2012

Mosaicking images of the corneal sub-basal nerve plexus using hierarchical block-based image registration
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2012. BMT 2012 : 46.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Jena, 16.-19.September 2012

Generating extended images of the corneal nerve plexus by guided eye movements
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Reichert, K.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2012. BMT 2012 : 46.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Jena, 16.-19.September 2012

Early detection of nerve fiber loss by in vivo corneal confocal microscopy in recently diagnosed type 2 diabetic patients
Ziegler, D.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Peschel, S.; Koehler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2012. American Diabetes Association (ADA) 72nd Scientific Sessions, Philadelphia, Pa., June 8-12, 2012 Book of Abstracts

Image Reconstruction of the Subbasal Nerve Plexus with In Vivo Confocal Microscopy
Allgeier, S.; Zhivov, A.; Eberle, F.; Koehler, B.; Maier, S.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2011. Investigative ophthalmology & visual science, 52 (9), 5022–5028. doi:10.1167/iovs.10-6065

Elastische Registrierung von in-vivo-CLSM-Aufnahmen der Kornea
Allgeier, S.; Köhler, B.; Eberle, F.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2011. Bildverarbeitung für die Medizin 2011 : Algorithmen, Systeme, Anwendungen; Proceedings des Workshops vom 20. bis 22. März 2011 in Lübeck. Hrsg.: H. Handels, 149–153, Springer-Verlag

Generating Extended Images of the Corneal Sub-Basal Nerve Plexus In Vivo
Allgeier, S.; Köhler, B.; Bretthauer, G.; Stachs, O.
2011. Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 56 (Suppl. 1). doi:10.1515/BMT.2011.342

Bildrekonstruktion des subbasalen Nervenplexus der Kornea mit erweitertem Bildfeld aus Fokusserien eines konfokalen Laser-Scanning-Mikroskops
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Guthoff, R.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Ziegler, D.; Bretthauer, G.
2011. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 228 (12), 1060–1066. doi:10.1055/s-0031-1281959

Subdifferenzierung des Hornhautepithels - eine neue Methode zur Charakterisierung von Oberflächenerkrankungen des Auges
Perotta, A.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2011. Herausforderungen in der Augenheilkunde : 109.DOG-Kongress, Berlin, 29.September - 2.Oktober 2011

Generating extended images of the corneal sub-basal nerve plexus in vivo
Allgeier, S.; Köhler, B.; Bretthauer, G.; Stachs, O.
2011. BMT 2011 : 45.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Freiburg, 27.-30.September 2011 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 56(2011) Suppl.1 Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2011.342

Bildrekonstruktion aus CLSM-Bildserien zur Quantifizierung der Hornhautinnervation in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2011. Herausforderungen in der Augenheilkunde : 109.DOG-Kongress, Berlin, 29.September - 2.Oktober 2011

Elastische Registrierung von in-vivo-CLSM-Aufnahmen der Kornea
Allgeier, S.; Köhler, B.; Eberle, F.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2011. Bildverarbeitung für die Medizin 2011 : Algorithmen - Systeme - Anwendungen, Lübeck, 20.-22.März 2011

Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer G.
2010. Biomedizinische Technik, 55 (Suppl. 1). doi:10.1515/BMT.2010.564

Ein neues Bildverarbeitungsverfahren zur zuverlässigen Erfassung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 55(2010) Suppl.1, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.450

Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 55(2010) Suppl.1, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.564

Quantification of confocal images of the subbasal nerve plexus of the cornea as a non-invasive staging parameter for diabetic neuropathy
Zhivov, A.; Winter, K.; Allgeier, S.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2010. 20th Annual Meeting of the Diabetic Neuropathy study Group of the EASD (Neurodiab XX), Stockholm, S, September 17-19, 2010

Ein neues Bildverarbeitungsverfahren zur zuverlässigen Erfassung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. Biomedizinische Technik / Supplement, BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010, Auch auf CD-ROM, 55 (S1), 178–81. doi:10.1515/BMT.2010.450

Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. Biomedizinische Technik / Supplement, BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.564, 55 (S1), 259–62. doi:10.1515/BMT.2010.701